Genomics England Ltd

Genomics England Ltd. wurde 2013 gegründet, um einen neuen genomischen Medizin-Dienst für den britischen National Health Service (NHS) zu schaffen. Mit dem Ziel, neue wissenschaftliche Entdeckungen und medizinische Erkenntnisse zu ermöglichen, wird das 100.000-Genome-Projekt letztendlich 100.000 Genome von rund 70.000 NHS-Patienten und ihren Familien mit seltenen Krankheiten und Krebserkrankungen sequenzieren. Das Projekt zielt darauf ab, neue wissenschaftliche Entdeckungen, medizinische Erkenntnisse und Diagnosen zu ermöglichen. Nach Abschluss des Projekts wird der NHS in der Lage sein, Patienten mit derzeit schwer zu behandelnden Erkrankungen genomische Medizin und personalisierte Behandlungen anzubieten. Dies wird durch die Kombination von Genomsequenzdaten und Patientenakten erreicht. Heute ist es das weltweit größte nationale Sequenzierungsprojekt seiner Art.

Genomics England ist ein Unternehmen, das sich vollständig im Besitz des britischen Gesundheitsministeriums befindet. Es bietet nicht nur genomische Medizin an, um die Art und Weise der Gesundheitsversorgung zu revolutionieren, sondern hat auch den Auftrag, die Genomikindustrie in Großbritannien anzukurbeln. Um effizient, flexibel und in der Lage zu sein, schnell auf Marktveränderungen zu reagieren, arbeitet das Unternehmen bei der Probenentnahme, Analyse und Datenspeicherung mit anderen Organisationen zusammen. Entscheidend ist jedoch, dass es die Hauptverantwortung für den Datenschutz behält.

Im Jahr 2014 begann Genomics England mit der Entwicklung und dem Aufbau einer sicheren technologischen Infrastruktur für die klinische Genomforschung durch die beteiligten akademischen, industriellen Forschungs- und NHS-Klinikorganisationen. Der Entwurf sollte den sicheren Datenzugriff und die Rechenressourcen erleichtern und die Software, Schnittstellen und Datenverarbeitungsressourcen definieren, die für die wissenschaftliche Zusammenarbeit und die Erstellung "analysereifer" Datensätze erforderlich sind.

Die Herausforderung

Die größte Herausforderung bestand darin, eine Anwendungsumgebung bereitzustellen, die für die Analyse und Verarbeitung von Genomsequenzierungsdatensätzen erforderlich ist, damit Forscher und Kliniker darauf zugreifen können. Die Umgebung musste die Sicherheits- und Datenschutzauflagen erfüllen, die vom NHS und dem unabhängigen Access Review Committee of Genomics England festgelegt wurden. Die Forscher mussten die Möglichkeit haben, die anonymisierten Ergebnisse ihrer Analysen herunterzuladen. Kliniker mussten in der Lage sein, geprüfte Datensätze, wie z. B. klinische Berichte, zu exportieren, jedoch nur für Teilnehmer, die von ihnen betreut wurden. Alle Daten, die ihre Systeme verlassen, müssen eine ‘Luftschleuse’ durchlaufen, wo überprüft wird, ob die exportierten Daten angemessen sind.

Um sicherzustellen, dass keine Rohdaten exportiert werden konnten, mussten die Verarbeitung und Analyse der Genomdaten vollständig und sicher in den Rechenzentren von Genomics England erfolgen. Das Design erforderte, dass Systemnutzer daran gehindert wurden, die Datenrichtlinien zu umgehen. Beispielsweise durfte es Benutzern nicht gestattet sein, Rohdaten in ihre eigenen Systeme zu ‘kopieren und einzufügen’. Das Design erforderte außerdem, dass die IT-Dienste für zugelassene Partner aus Wissenschaft, Forschung und Industrie bereitgestellt werden konnten, ohne dass eine Autorisierung, Installation und Verwaltung von Client-seitiger Software erforderlich war.

Die Lösung

Genomics England hat sich für die OVD Enterprise-Plattform von Inuvika entschieden, um die Desktop-Umgebung, den Anwendungszugriff und das Verwaltungsframework für das 100.000-Genome-Projekt bereitzustellen. Über einen “Lesesaal” erhalten Benutzer eingeschränkten Fernzugriff auf ihre Forschungsumgebung und die anonymisierten Datensätze über das OVD HTML5-Client-Gateway und einen veröffentlichten Windows-Desktop.

Auf dem Remote-Client mit HTML5-Unterstützung werden keine Daten übertragen oder gespeichert. Nur Bildschirm-, Maus- und Tastaturdaten werden über eine verschlüsselte Verbindung gesendet. Die richtlinienbasierte Zugriffsfunktion von OVD stellt sicher, dass keine unbefugte Übertragung von Daten an den Endbenutzer möglich ist. OVD deaktiviert die Verbindung von clientseitigen Speichergeräten wie Festplatten und USB-Speichern sowie alle Funktionen zum Ausschneiden und Einfügen.

“Wir haben uns für Inuvika OVD Enterprise entschieden, weil es die Anforderungen unserer Forschungsumgebung an Windows- und Linux-Anwendungen erfüllt und gleichzeitig die Projektdaten sicher ‘abschotten’ kann.
innerhalb unserer Rechenzentren”, sagte David Brown, Leiter der IT-Infrastruktur.

“Da keine Client-Software auf dem lokalen Gerät des Benutzers installiert werden muss und keine Firewall-Eingriffe an Remote-Client-Standorten erforderlich sind, wird der sichere Zugriff für Forscher, Kliniker, Wissenschaftler und Datenanbieter sehr einfach.”